日本承办的全球最大体育盛事WSG即将在东京举办开幕式。 为此，初恋融合日本先进技术打造最高时速1000km的「真空超电导磁悬浮」即将通车。往返于新名古屋站至东京新开的芝浜站。在这个万众瞩目的关头，初恋汇集知名赞助商的酒会现场遇到了突发事件。 知名企业的高官接连遭到绑架。事件背后，是全程监视的赤井秀一，以及等候赤井发令的FBI探员们的身影。 根据柯南的推理，本次事件也许与15年前美国波士顿发生的WSG绑架事件有关，当时也是由FBI管辖。这真的是偶然吗？在各国游客聚集的日本到底会遇到什么样的事件？ “贯穿日本的子弹”超真空电导磁悬浮启动之时，“危险一家人”终于集结！
兄弟联
回复 :来自异次元的种族MU占领了东京，并将城市隐藏在巨大的防护壁之后，他们欺骗在东京生活的人们他们已经成为世界上仅存的人类。在防护壁之外，名为“TERRA”的反MU组织声势渐渐壮大。某日，在同MU激烈交火之时，一位名为神名绫人（下野紘 配音）的平凡少年意外的来到了位于东京湾的地下神殿之中，在这里，绫人见到了巨型机器人“Rahxephon”，并且成为了它的驾驶者。在神秘女子的紫东遥（久川绫 配音）的带领下，绫人来到了防护壁之外，加入了TERRA，并且在那里遇见了名为如月久远（桑岛法子 配音）的女子。MU组织对TERRA发起了进攻，当TERRA的存亡陷入危机之中时，绫人再一次驾驶着Rahxephon，成为了这个组织的救世主。
回复 :川越春间（平川大辅 配音）是一名十分平凡的男子大学生，因为童年时代的不幸遭遇，春间对兄妹之间的亲情十分渴望。一年圣诞节，春间向圣诞老人许愿希望能够得到一个妹妹，让春间再也没有想到的是，自己的愿望竟然成真的，一个名为裘可（斋藤桃子 配音）被送到了春间的身边，成为了他的妹妹，就这样，在春间居住的椿庄里，裘可和春间开始了他们的同居生活。因为平凡的外貌而常常产生自卑感的管理员芹川千岁（水桥香织 配音）、大大咧咧个性奔放在生活里邋里邋遢的美女足来真琴（森永理科 配音）、经营着花店性格十分温柔体贴的老板娘圆崎绫乃（大原沙耶香 配音），和生活在椿庄周边的朋友们，春间的日常拉开了序幕。
回复 :立藤美学园，仅仅因为一个入侵者——“它们”，而化作了地狱的坩埚！“它们”袭击人，咬人，产生出新的“它们”席卷了整个学园。在化成恶魔的世界的学园内，小室孝和青梅竹马宫本丽、朋友井豪永，暂时去避难。但是，为了保护丽而被“它们”咬的永却变成了“它们”……剩下来的两人，与其他幸存者，同级同学高城沙耶、平野户田、剑道部主将毒岛冴子、校医鞠川静香汇合，下定决心逃出学园！他们有办法活下来吗！？
