在一次邂逅中得到死神的力量而成为“代理死神”的黑崎一护，动物被卷入死在现世的魂魄所聚集的地方——尸魂界的动乱中，动物在激烈的战斗中和同伴一起也成长了很多。因为一护的生活，所生活的空座町发生了异变。新的死神和新的敌人的出现，以及呼救声。一护再次拿起斩魄刀，踏上战场。另一方面，在尸魂界观测到现世中的虚突然连续消失被引导到这片土地的灵魂所生活的流魂街居民们发生了失踪并且死神们驻守的灵屋・瀞灵廷被贼军袭击。贼军的真实身份是灭却师始祖・友哈巴赫所率领的“无形帝国”。“无形帝国”向死神们宣战。5天后，尸魂界被“无形帝国”歼灭历经千年之久死神们所背负的因缘。那个宿命和隐藏的真相终于被揭开。一切都走向终结。黑崎一护，最后的战斗开始了——